Προερχόμενος από τον ΠΑΣ Γιάννενα, ήρθε στον Παναθηναϊκό επί Αγγελου Αναστασιάδη και έκανε ονειρεμένο ευρωπαϊκό ντεμπούτο σκοράροντας κατά της Μάντσεστερ Γιουνάιτεντ στο Τσάμπιονς Λιγκ. Η πορεία του στα ευρωπαϊκά παιχνίδια με τους "πράσινους" έκανε πολλές ομάδες να τον προσέξουν. Τελικά μετά το θρίαμβο της Πορτογαλίας έφυγε για την Πόρτο, ενώ μετά ακολούθησαν η Ντιναμό Μόσχας και η Ατλέτικο Μαδρίτης. Ταλαιπωρημένος από τραυματισμούς που χρόνια τώρα δεν τον άφησαν να κάνει "γεμάτες" σεζόν ο Γιούρκας έκανε... μέτρια σεζόν, χωρίς να καταφέρει να βοηθήσει σημαντικά την ομάδα του που τον δέχθηκε ξανά πίσω στην αγκαλιά της. Όταν ο Σεϊταρίδης αποχωρούσε από την Παιανία ως νταμπλούχος το 2004, είχε δείξει ενδιαφέρον γι αυτόν μέχρι και η Ρεάλ Μαδρίτης, αλλά πρόλαβε και τον άρπαξε η Πόρτο. Από τότε κύλησε πολύ νερό στο αυλάκι, ο Σεϊταρίδης γύρισε στην Ελλάδα σαφώς επηρεασμένος απο την αγωνιστική απραξία, αλλά στέφθηκε εκ νέου πρωταθλητής και κυπελλούχος, τη σεζόν 2009-2010.